人类基因组分类(医学遗传学视角)
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按基因组组成分类
编码基因
- 蛋白质编码基因(≈2–2.5万)
- 结构基因
- 编码结构蛋白或酶
- 例:血红蛋白基因
- 编码结构蛋白或酶
- 调节基因
- 编码转录因子/信号分子
- 例:p53抑癌基因、SOX发育调控家族
- 编码转录因子/信号分子
- 结构基因
- 非编码RNA基因(≈8 000种)
- rRNA/tRNA
- 翻译机器核心组分
- miRNA
- 转录后调控小RNA
- lncRNA
- 长链非编码RNA,参与表观遗传
- rRNA/tRNA
非编码序列
- 调控序列(4–5%)
- 启动子、增强子、沉默子
- 决定基因时空表达
- 启动子、增强子、沉默子
- 重复序列(55–75%)
- 串联重复
- 卫星DNA、微卫星
- 用于指纹图谱与连锁分析
- 卫星DNA、微卫星
- 散在重复
- LINEs、SINEs、转座子
- 可移动遗传元件
- LINEs、SINEs、转座子
- 假基因
- 功能丧失的拷贝残余
- 串联重复
- 基因间序列(≈20%)
- 基因沙漠区
- 潜在远程调控或未知功能
- 基因沙漠区
按基因功能分类
单基因
- 单拷贝基因
- 多数结构基因
- 多拷贝基因
- rRNA基因家族
- 提高表达剂量
- rRNA基因家族
基因家族
- 同源基因
- Hox家族
- 胚胎体轴发育调控
- Hox家族
- 功能相关家族
- 拓扑异构酶家族
假基因
- 基因组稳定性“旁系干扰源”
按分布位置分类
核基因组(99.9%)
- 23对染色体
- 常染色体22对
- 性染色体1对
- 基因密度差异:19号最高,Y最低
线粒体基因组
- 闭环双链mtDNA
- 编码13蛋白、2rRNA、22tRNA
- 氧化磷酸化核心
- 编码13蛋白、2rRNA、22tRNA
按序列特征分类
单拷贝序列(≈45%)
- 高特异性功能区域
重复序列(≈55%)
- 高度重复
- Alu(占基因组10%)
- 中度重复
- 转座子残余
- 低度重复
- 基因家族成员
按遗传特性分类
单基因遗传相关基因
- 突变→单基因病
- 例:CFTR(囊性纤维化)、F8(血友病)
多基因遗传相关基因
- 微效基因+环境
- 例:高血压、糖尿病易感基因
表观遗传调控元件
- DNA甲基化、组蛋白修饰
- 印记基因、环境应答基因
